游戏共分为六个章节，每个章节都有其独特的主题和难度，在初始的埃斯特城堡中，玩家需要细心观察环境，利用小金属旋钮和摇把等机关，打开铁门，逐步深入城堡的内部，随后的章节中，玩家将面临更多的挑战，如解盒子密码、查看念珠、拖拽罗马数盘等，每一个步骤都需要玩家动脑筋，发挥想象力和创造力。
除了基本的解谜操作，游戏还考验玩家的观察力和记忆力，在某些关卡中，玩家需要根据图案或提示，找到对应的物品或机关，这要求玩家对环境中的每一个细节都了如指掌，游戏还融入了时间旅行的元素，玩家可以通过“永恒之眼”改变现在，这一设定不仅增加了游戏的趣味性，也让解谜过程更加丰富多彩。
《达芬奇密码2》手游是一款极具挑战性的解谜游戏，玩家在游戏中不仅需要运用智慧和勇气，还需要细心观察，善于发现隐藏在细节中的线索，只有这样，才能成功解开所有的谜题，揭开最终的秘密。